2008: Trung tâm Quan trắc và Ứng dụng phát triển công nghệ môi trường được thành lập
2010: Đổi tên Trung tâm Quan trắc và Ứng dụng phát triển công nghệ môi trường thành Trung tâm Môi trường và Sản xuất sạch
2015: Trung tâm Môi trường và Sản xuất sạch được Bộ Tài Nguyên & Môi trường cấp Giấy chứng nhận đủ điều kiện thực hiện dịch vụ quan trắc môi trường - Lần thứ nhất
2018: Trung tâm Môi trường và Sản xuất sạch được Bộ Tài Nguyên & Môi trường cấp Giấy chứng nhận đủ điều kiện thực hiện dịch vụ quan trắc môi trường - Lần thứ hai
2020: Trung tâm Môi trường và Sản xuất sạch được Văn phòng công nhận chất lượng - Bộ Khoa học và Công nghệ cấp Chứng chỉ công nhận chất lượng ISO/IEC 17025:2017 lĩnh vực hóa
2021: Trung tâm Môi trường và Sản xuất sạch được Bộ Y tế xác nhận công bố đủ điều kiện thực hiện quan trắc môi trường lao động
2024: Trung tâm Môi trường và Sản xuất sạch được Bộ Tài Nguyên & Môi trường cấp Giấy chứng nhận đủ điều kiện thực hiện dịch vụ quan trắc môi trường - Lần thứ tư